作者:Alexander Katsyv et al.
发表日期:202103
发表期刊:FEBS Open Bio


研究背景

Wood–Ljungdahl pathway (WLP) 是最早出现在地球的CO2固定代谢途径,它依赖严格的厌氧微生物产乳酸菌、产甲烷菌、硫化菌和古生菌。在WLP途径中2分子CO2 转化为中央代谢的乙酰辅酶A (acetyl-CoA)。产乙酸菌再转化为乙酸。大多数产乙酸菌可以维持无机自养的生命循环,使用H2和CO作为电子供体固定CO2生成乙酸。 

WLP途径的ATP得失为零,因此根据化学渗透假说,它们需要能量的转化来维持细胞代谢的平衡。自养代谢和异养代谢的中心环节就是乙酰辅酶A。2个关键酶作用于这一环节,分别是一氧化碳脱氢酶和乙酰辅酶A合成酶 (CODH/ACS),结合了WLP途径中的甲基和CO,而丙酮酸铁氧还蛋白氧化还原酶 (PFOR) 可以还原乙酰辅酶A羧酸盐到丙酮酸。

PFOR是细菌厌氧代谢的关键酶,从低电势的铁氧还蛋白 (Fd2) 作为电子载体,此酶可以用作酶促反应的辅酶,在需要Fd作为电子受体的反应中,比如电子差异酶,以维持还原性Fd的恒定水平。

实验方法

在66℃的厌氧条件下培养T. kivui菌,优化微量元素,通H2和N2。收集细胞破碎130,000 g离心,4℃ 60 min收集上清。

在T. kivui中重组表达non-tagged PFOR和His-tagged PFOR1纯化路线。
PFOR透析到50 mM Tris-HCl,2 mM DTE,4 μM resazurin,20% (v/v) glycerol,pH 8.0进行阴离子交换层析捕获。3-13 mM NaCl 或电导3.8–8.4 mS/cm洗脱。样品加入1 M AMS进行疏水相互作用层析中度纯化,50 mM Tris-HCl,20 mM MgSO4,2 mM DTE,4 μM resazurin,20% (v/v) glycerol,,pH 7.5线性洗脱。50 kDa VIVASPIN 超滤浓缩,衔接凝胶过滤尽行精细纯化,50 mM Tris-HCl,150 mM NaCl,20 mM MgSO4,2 mM DTE,4 μM resazurin,20% (v/v) glycerol,pH 7.5,获得单峰。
PFOR1捕获步骤为镍柱亲和层析,30 mM imidazole洗杂,50 mM Tris-HCl,150 mM NaCl,20 mM MgSO4,400 mM imidazole,0.5 mM DTE,4 μM resazurin,20% (v/v) glycerol,pH 7.5洗脱,超滤后衔接凝胶过滤精纯。

非标签PFOR纯化倍数为50.4,三步纯化的回收率3.6%。his标签PFOR1的纯化倍数为35.8,两步纯化的回收率为93.9%。

 

产品信息

类别 货号 产品名称 规格
预装柱 28990944 Superdex 200 Increase 10/300 GL 1 x 24 mL
填料 17101401 Q Sepharose HP 75 mL
填料 17108201 Phenyl Sepharose High Performance 75 mL
填料 17526801 Ni Sepharose HP 25 mL
超滤管 28932362 Vivaspin 20, MWCO 50 kDa 12个
空柱 28988946 Column XK 16/70 16/70

Reference
A. Katsyv et al. Pyruvate:ferredoxin oxidoreductase of Thermoanaerobacter kivui. FEBS Open Bio 11 (2021) 1332–1342