作者:Sabine Johnson et al.
发表日期:2018年2月1日
发表期刊:Journal of the International Association of Biological Standardization


研究背景

慢病毒载体 (LV) 已在多项临床试验中用于治疗单基因疾病,例如 β-地中海贫血、Wiscott-Aldrich 综合征和异染性脑白质营养不良 (MLD) 。除了造血干细胞 (HSC) 的离体治疗外,LV 还可以有效地转导树突状细胞 ,因为它们有可能在更大的患者群体中用作疫苗。最常见的慢病毒载体是通过瞬时转染产生的。载体只能在短时间内生产且难以扩大规模。此外,产生的载体中存在 DNA 质粒需要对其进行纯化,从而使下游加工复杂化。随着对大量 LV 的需求增加,需要稳定表达 LV 的包装细胞系。

在这项研究中使用尺寸排阻色谱 (SEC) 纯化慢病毒载体,然后使用 LC-MS/ MS 分析纯化载体中的蛋白质组成,这些纯化载体由用 VSV-G 假型的瞬时生产和用 RDpro 包膜蛋白假型的稳定生产细胞系 STAR 产生。进一步分析了这些蛋白质对使用小发夹 RNA (shRNA) 介导的基因调控的载体生产的影响。结果显示敲低表达对载体生产水平的影响不显着。

实验方法

慢病毒载体通过瞬时转染 HEK 293T 细胞或通过稳定的生产细胞系产生。制备了六种不同的载体样品,对于载体样品制备,将细胞接种在 15 cm 培养皿上。对于载体样品 1- 4 细胞在 24 小时后瞬转。24 h更换培养基后再经后24 小时和 48 小时收集含有上清液的载体。通过超速离心浓缩每个板的上清液至最终体积为900μl。瞬转产生的载体样品浓缩40 倍,而稳转产生的载体浓缩了240 倍。

样品通过 Sephacryl-500-HR 介质填充的XK16/70 柱分离。含有 150 mM NaCl、1 mM EDTA、10 mM Tris-HCl pH 7.4 的 10 种缓冲液用作样品运行缓冲液。对于尺寸排阻色谱法,每柱以 0.8 mL/min 的流速纯化 900 μL 粗载体样品。将总共 8 次运行的 900 μL粗载体样品的空峰级分汇集起来,并使用 slide-A-Lyzer 透析盒(容量 3-12 mL,截留分子量 10000 Da)在3 L 10 mM 碳酸氢铵 (ABC),pH 8.0 缓冲液体系进行。用 Edwards E2M2 高真空泵将透析过的样品冷冻干燥并重新悬浮在蒸馏水中。使用 BSA 蛋白标准品通过 Bradford Protein Assay对总蛋白量进行定量。用 LC-MS/MS 进行纯化的慢病毒载体表征。

产品信息

类别 货号 产品名称 规格
预装柱 28935606 HiPrep 16/60 Sephacryl S-500 HR 1 × 120 mL
填料 17061310 Sephacryl S-500 HR 150 mL
空柱 28988946 Column XK 16/70 16/70

Reference
Johnson S, Wheeler JX, Thorpe R, et al. Mass spectrometry analysis reveals differences in the host cell protein species found in pseudotyped lentiviral vectors. Biologicals : Journal of the International Association of Biological Standardization. 2018 Mar;52:59-66. DOI: 10.1016/j.biologicals.2017.12.005. PMID: 29361371; PMCID: PMC5910304.